Ipswich PC-1186 - Geschichte

Ipswich PC-1186 - Geschichte


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Ipswich

(PC-1186: dp. 295, 1. 174'; T. 23'; dr. 8'; s. 19 k.; kpl.
65; a.13'',140mm.,220mm.,2rkt.,4dcp.,2dct.)

PC-1186 wurde von der Gibbs Gas Engine Co., Jacksonville, Florida, am 20. April 1943 festgelegt; ins Leben gerufen am 27. September; gesponsert von Mrs. George Wharton und beauftragt am 9. Juni 1944, Lt. (j.g.) Paul L. Adams im Kommando.

Nach dem Shakedown und dem ASW-Training vor Miami, Florida, wurde PC-1186 dem Konvoi-Escortdienst im Atlantik zugeteilt. Von August bis Dezember führte sie Begleit-, Patrouillen- und Aufklärungsaufgaben von der Küste Neuenglands bis nach Guantanamo auf Kuba aus. Ende Dezember 1944 kam Coco Solo, C.Z., für Patrouillen- und Eskortoperationen zwischen dem Panamakanal und Kuba an.

PC-1186 setzte diese Dienste für den Rest des Zweiten Weltkriegs fort. Nach dem Krieg patrouillierte sie vor der Kanalzone und führte Trainingsübungen mit U-Booten durch, bis sie am 7. Mai 1946 nach Charleston, SC, segelte. PC-1186 erhielt den Namen Ipswich am 15. Februar 1956. Ipsich wurde am 1. April 1959 von der Navy List gestrichen und am 16. September 1959 an Hughes Brothers, Inc. verkauft.


Ipswich School – eine kurze Geschichte

Aus dieser bescheidenen Herkunft nahm die Frühgeschichte der Schule mit der Machtergreifung des ehemaligen Schülers Thomas Wolsey einen ganz anderen Verlauf. Wolsey machte sich daran, die Schule neu zu gründen, um Schüler für sein College in Oxford bereitzustellen. Thomas Cromwell, Wolseys vertrauenswürdiger Berater, übernahm die Aufgabe und löste zwölf lokale Klöster auf, um die Schule zu bezahlen.

Doch etwas mehr als ein Jahr später fiel Wolsey, der die dringend benötigte Scheidung für Heinrich VIII. Steine ​​für neue Schulgebäude wurden von Ipswich nach London verschifft und zum Bau des heutigen Palace of Whitehall verwendet. Gegen alle Widrigkeiten überlebte die Ipswich School. Cromwell überzeugt
Henry, der Schule ihre erste Urkunde zu erteilen, die später von Elizabeth I.

Im 19. Jahrhundert zog die Ipswich School an ihren heutigen Standort neben dem Christchurch Park. Fürst Albert legte 1851 den Grundstein für das Hauptschulgebäude. Kurz darauf wurde 1883 die Prep School gegründet
für Kinder im Alter von 7 bis 11 Jahren eingerichtet und bildet ein Sprungbrett in die Senior School. 2006 bezog es seinen markanten Neubau.

Die Ipswich School kann eine Reihe herausragender ehemaliger Schüler vorweisen: Thomas Wolsey, Kardinal, Erzbischof von York und Lordkanzler von England unter Heinrich VIII., hat mit ziemlicher Sicherheit die Schule besucht. Bedeutende Männer der Aktion sind Thomas Howard, Duke of Norfolk, der englische Kommandant in der Schlacht von Flodden, und Konteradmiral Sir Philip Broke. Er führte die HMS Shannon in einem gefeierten Engagement mit der USS Chesapeake. Der Schriftsteller Henry Rider Haggard war hier in den 1870er Jahren Schüler und bedeutende Künstler wie Sir Edward Poynter, Präsident der Royal Academy, Charles Keene of Punch und Edward Ardizzone besuchten die Schule. Auf dem Gebiet der Wissenschaft ist der bahnbrechende Neurophysiologe und Nobelpreisträger Sir Charles Sherrington der bisher angesehenste Old Ipswichianer.


Ipswichhistory

The Bone Detectives ist ein Channel-4-Programm, in dem Tori Herridge und ein Team von Wissenschaftlern Lebensgeschichten hinter ausgegrabenen Knochen zusammensetzen.

In der neuesten Folge konzentriert sich das Team auf einen längst vergessenen Friedhof in Ipswich, auf dem 1400 Leichen Anzeichen von harter Arbeit, Krankheit, Mord und möglicherweise der ersten Obduktion des Landes zeigen.

Ich wurde vom Produktionsteam gebeten, bei einigen der Recherchen zu helfen, die sie für das Programm durchführten, und dann eingeladen, in einem kurzen Interview in der Episode mitzuwirken.

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IPSWICH HISTORY-PODCAST-FOLGE 6

IPSWICH UND DIE HANSEATIC LEAGUE

In dieser Folge spreche ich mit Pat Grimwade vom Ipswich Maritime Trust über ihre neue Veröffentlichung über die wenig bekannten Verbindungen von Ipswich zur Hanse.

Die Hanse war eine Konföderation von Handelsgilden, die einst einen Großteil des europäischen Handels im Spätmittelalter dominierte und Häfen aus Deutschland, den Niederlanden, Skandinavien, dem Baltikum sowie einigen in Großbritannien, darunter Ipswich, verband. Auf ihrem Höhepunkt stellte die Hanse sogar eine Streitmacht zusammen, die einen Krieg gegen Dänemark gewann.

Pat erzählt uns, wie Ipswich zu einem Hansehafen wurde, welche Dinge während dieser Zeit von und nach Ipswich gehandelt wurden und welche physischen Beweise für die hanseatischen Verbindungen der Stadt heute noch vorhanden sind.

Können Sie die auffallende Ähnlichkeit zwischen diesen mittelalterlichen Siegeln aus Danzig (heute Danzig, Polen) und Elbing (heute Elbing, Polen) und Ipswichs eigenem Stadtsiegel erkennen? Mehr dazu erfahren Sie auch in dieser Podcast-Folge.

Sie können den Podcast bei iTunes, Spotify usw. anhören und abonnieren oder online streamen: https://anchor.fm/caleb-howgego

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IPSWICH HISTORY-PODCAST-FOLGE 5

FRÜHE PRÄHISTORISCHE IPSWICH

Diese Episode enthält ein Gespräch mit Hannah Cutler vom Archäologischen Dienst des Suffolk County Council über das frühe prähistorische Ipswich.

Hannah spricht darüber, wie das Gebiet, aus dem eines Tages Ipswich werden sollte, während des Paläolithikums (Altsteinzeit) und Mesolithikum (Mittelsteinzeit) aussah. Hannah erzählt uns auch von der Arbeit, die sie derzeit unternimmt, um den Historic Environment Record für dieses Gebiet zu aktualisieren. Dazu gehört die Verbesserung der online verfügbaren Informationen, die die Öffentlichkeit selbst erkunden kann, indem sie https://heritage.suffolk.gov.uk besucht /

Wir hören auch von einigen historischen lokalen Ausgrabungen früher prähistorischer Funde, darunter von Nina Layard, einer bahnbrechenden frühen Archäologin und Antiquarin.

Sie können es auf iTunes, Spotify usw. anhören oder online streamen: https://anchor.fm/caleb-howgego

Nina Layard, Spitzhacke in der Hand, die die Ausgrabungen an der Foxhall Road in Ipswich 1903-1905 leitete

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IPSWICH HISTORY-PODCAST-FOLGE 4

Die Orwell-Brücke über den Fluss Orwell

Sie können die Episode anhören, indem Sie bei iTunes, Spotify usw. nach dem Podcast suchen oder ihn online streamen: https://anchor.fm/caleb-howgego

In dieser Episode spreche ich mit Andy Parker darüber, wie der Fluss Orwell 1519 von König Heinrich VIII. an Ipswich geschenkt wurde und warum Ipswich die einzige Stadt des Landes zu sein scheint, die einen Fluss besitzt.

Andy arbeitet ehrenamtlich für den Ipswich Maritime Trust, der die erstaunliche maritime Geschichte und das Erbe des Flusses Orwell und Ipswich schützen und fördern möchte. Andy hat einen Artikel für den Ipswich Star geschrieben, in dem erklärt wird, wie Ipswich den Fluss Orwell geschenkt bekam, den Sie unter diesem Link lesen können:

Ich spreche auch mit meinem Vater, David Howgego, darüber, wie er zum Freeman of Ipswich wurde und welche zusätzlichen Rechte (wenn überhaupt) Freeman heute tatsächlich zustehen.

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So was:

IPSWICH HISTORY-PODCAST-FOLGE 3

Diese Mini-Episode der Podcasts befasst sich mit der Geschichte von Chestnut Pond am östlichen Stadtrand von Ipswich in Rushmere St. Andrew und seinen früheren Verbindungen zum Schmuggel.

Es erzählt auch eine andere lokale Geschichte darüber, wie ein Ort namens Cat House einst eine Rolle beim Schmuggel auf dem Fluss Orwell spielte.

Sie können die Folge bei iTunes, Spotify etc. finden oder online streamen: https://anchor.fm/caleb-howgego

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So was:

BBC RADIO SUFFOLK-INTERVIEW

Kürzlich wurde ich sehr freundlich gebeten, als Sofagast in Lesley Dolphins BBC Radio Suffolk-Sendung über die lokale Geschichte zu sprechen und wie ich mich dafür interessierte. Dies ist das Audio aus meinem Interview aus der Sendung, die am 16. März 2020 ausgestrahlt wurde.

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STADTWÄNDE

Ipswich war nicht immer die relativ friedliche Stadt, die wir heute finden. Es gab einmal eine Zeit, in der es Überfällen ausgesetzt war, gelegentlich sogar von kontinentalen Plünderern. Eine Möglichkeit, wie die Bewohner des mittelalterlichen Ipswich versuchten, ihrer Stadt mehr Sicherheit zu verleihen, war der Bau einer Verteidigungsanlage. Heute scheint es in Ipswich keine Spur von einer alten Stadtmauer zu geben, also was waren die Stadtverteidigungen und wann sind sie verschwunden?

Es ist eine Aufzeichnung erhalten, die erwähnt, dass im Jahr 1203 Stadtgräben ausgehoben wurden, aber dies könnte sich auf die Erweiterung einer noch älteren Verteidigungslinie bezogen haben. Während in den folgenden Jahrhunderten einige Hinweise auf Stadtmauern in Dokumenten gegeben werden, werden die Verteidigungsanlagen häufiger als die „großen Gräben der Stadt“ bezeichnet. Ein Befehl aus dem Jahr 1604, einen Kiesweg auf der Oberseite der Mauern zu legen, macht deutlich, dass die meisten, wenn nicht alle Wälle an dieser Stelle eine Erdbank und keine Steinmauer waren. Es ist daher wahrscheinlich, dass die Verteidigung aus einer Reihe von Gräben und Erdwällen bestand, die an ihren schwächsten Stellen durch Mauern verbunden waren. Diese Verteidigungslinie hätte sich um den westlichen, nördlichen und östlichen Rand von Ipswich herumgebogen – der südliche Rand der Stadt verlief bis zum Fluss Orwell. Als die Stadt wuchs, entwickelten sich Gemeinden außerhalb der Stadtmauer, aber die Bewohner genossen mehr Sicherheit, obwohl sie für das Privileg mehr Steuern zahlten.

Während die Verwendung von Steinmauern minimal zu sein scheint, gab es sicherlich in Abständen Steintore um die Stadtmauern. Ipswich war in der Vergangenheit eher ein Handelszentrum als eine militärische Festung, und die Tore wurden sowohl zur Regulierung des Handels als auch zur Sicherheit verwendet. Wagenladungen mit Waren kamen an diesen Toren an und wurden dann entweder in die Stadt eingelassen oder verweigert. Eines der beeindruckendsten davon war das Westtor, ein imposantes Bauwerk mit Zinnen, das 1448 zu einem langjährigen Gefängnis umgebaut wurde.

Ein genauer Blick auf die Karte von John Speed ​​von 1610 zeigt die Stadtmauern (besonders deutlich nördlich der Stadt). Der Schlüssel listet auch die verschiedenen Stadttore auf.

Das Westgate wurde in den 1780er Jahren abgerissen und in den frühen 1900er Jahren waren so ziemlich alle Wälle, Gräben und Tore verschwunden. Der letzte offensichtliche Ort, an dem eine der ehemaligen Verteidigungsanlagen zu sehen war, befand sich nördlich der Stadt, wo einige viktorianische Häuser auf einem Erdwall thronten. Dieser Bereich wurde dann abgeflacht und in einen Parkplatz umgewandelt und wurde später zum Busbahnhof an den Tower Ramparts.

Ein Foto des Einkaufszentrums Tower Ramparts aus dem Jahr 2014, bevor es saniert und in Sailmakers umbenannt wurde

Während die physischen Überreste verschwunden sind, lebt die Erinnerung an die Wälle und Tore noch heute an Ort und Straßennamen in Ipswich wie Tower Ramparts und Northgate Street. Am nächsten können wir die Stadtverteidigung jetzt sehen, wenn wir das Hellebarde-Gasthaus besuchen, da man sagt, dass die letzten Spuren des Nordtors in den Keller dieses Gebäudes eingearbeitet wurden.

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So was:

IPSWICH HISTORY-PODCAST-FOLGE 2

Folge 2 – Ipswich des 17. Jahrhunderts und die ostanglianischen Hexenjagden

Im Jahr 1645 begann die größte Hexenjagd in der englischen Geschichte und East Anglia war sein düsteres Zentrum. Hunderte von Menschen wurden in den folgenden Jahren in East Anglia gehängt, nachdem sie wegen angeblicher Hexerei vor Gericht gestellt worden waren. Eine Frau namens Mary Lackland, die in Ipswich lebte, wurde jedoch zu der besonders extremen Strafe verurteilt, für ihre angeblichen Verbrechen verbrannt zu werden.

In dieser Episode des Podcasts spreche ich mit David Jones über sein Buch Die Hexenjagd von Ipswich, Mary Lackland und die Hexenjagd in Suffolk.

Wir sprechen darüber, wie das Leben der Menschen im Ipswich des 17. angeklagt, und was hinter der Entstehung von Hexenprozessen auf solch extremem Niveau in den 1640er Jahren stecken könnte.

Der Podcast ist bei iTunes, Spotify und den meisten anderen Podcast-Anbietern verfügbar. Wenn Sie keinen Zugriff auf ein Gerät mit einer Podcast-App haben, können Sie sich auch über diesen Link den Ipswich History Podcast anhören

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So was:

IPSWICH IN 50 GEBÄUDEN

Ich freue mich, Ihnen mitteilen zu können, dass ein neues Buch, an dem ich gearbeitet habe, aufgerufen wurde Ipswich in 50 Gebäuden wird am 15.06.2019 veröffentlicht.

Ich werde die Veröffentlichung des Buches mit einer Signierstunde im Ipswich Museum am Samstag, den 6. Juli um 14 Uhr feiern, wo das Buch auch im Museumsshop erhältlich sein wird. Alle sind herzlich eingeladen, dabei zu sein – es wäre schön, Sie dort zu sehen!

Hier ist der Klappentext, wenn Sie mehr darüber erfahren möchten Ipswich in 50 Gebäuden:

Ipswich hat eine faszinierende Geschichte, die auf seine angelsächsischen Wurzeln als Siedlung am Ufer des Flusses Orwell in East Anglia zurückgeht. Seitdem ist die Stadt einer der wichtigsten Häfen Englands, ein Zentrum des mittelalterlichen Wollhandels und entwickelte sich im viktorianischen Zeitalter zu einem blühenden Industriezentrum. Die unverwechselbare Geschichte von Ipswich spiegelt sich in den Gebäuden wider, die die Stadt im Laufe der Jahrhunderte geprägt haben, da aufeinanderfolgende Generationen ihre eigenen architektonischen Spuren hinterlassen haben.

Ipswich in 50 Gebäuden erforscht die reiche Geschichte der Stadt anhand einer Auswahl ihrer architektonischen Juwelen, von prächtigen mittelalterlichen Kirchen und Tudor-Schätzen wie dem Christchurch Mansion bis hin zu modernen Meisterwerken wie dem bahnbrechenden Design des Willis Building. Der Autor und Historiker Caleb Howgego feiert das architektonische Erbe von Ipswich auf eine neue und zugängliche Weise, während er den Leser durch die historischen und modernen Gebäude der Stadt führt.

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So was:

BASILIKUMBRAUN EVENT

Wie Sie wissen werden, wenn Sie ein langjähriger Leser dieses Blogs sind, bin ich ein großer Fan des Suffolk-Archäologen Basil Brown. Ich habe Anfang des Jahres einen Podcast über ihn gemacht, den ihr hier hören könnt

Ich werde am Sonntag, den 25. November 2018, 14.15-15.15 Uhr, eine Museumsgeheimnis-Veranstaltung im Ipswich Museum über Basil Brown (der selbst einmal Museumswärter im Ipswich Museum war) leiten. Es ist kostenlos und eine Drop-In-Veranstaltung, sodass Sie für die Teilnahme keine Buchung vornehmen müssen.

Weitere Informationen zur Veranstaltung finden Sie unter diesem Link: Museum Secrets – Basil Brown: Suffolk’s Archaeologist


Oberstufen

A Level History bietet einen interessanten und herausfordernden Kurs, der Ihre Analysefähigkeiten und Ihre Fähigkeit, überzeugende, klare Argumente zu schreiben, verbessert. Es ist eine Qualifikation, die von wettbewerbsfähigen Universitäten geschätzt wird, unabhängig davon, ob Sie sich für einen Abschluss in Geisteswissenschaften, Sozialwissenschaften oder Naturwissenschaften bewerben.

Sie werden von Lehrkräften gefördert, die in ihren Fachgebieten tätig sind. Die Kurse werden mit Materialien durchgeführt, die von der Abteilung geschrieben und durch eine breite Palette relevanter Bücher unterstützt werden.

Sie werden in Richtung weiterführender Lektüre geführt, wenn sich Ihre eigenen Interessen entwickeln. Sie werden ermutigt, sowohl mit Ihren Kollegen als auch mit Ihren Lehrern zu streiten und zu debattieren. Im Laufe der Zeit wird von Ihnen auch erwartet, dass Sie selbstständig arbeiten und ein selbstständiger Lerner werden. Am wichtigsten ist, dass Sie einige der faszinierendsten und umstrittensten Aspekte der modernen Geschichte behandeln.

Im Jahr 12 untersuchen wir die Geschichte Deutschlands und Westdeutschlands von 1918-1989, einschließlich einer Untersuchung der historischen Debatte um die Ursachen des Zweiten Weltkriegs. Dies wird von einem Papier begleitet, das den Aufstieg und Fall des Faschismus in Italien c1911-1946 betrachtet. In Jahr 13 betrachten wir die Beziehung zwischen Irland und der Union c1774-1923. Es gibt auch ein Kursmodul, in dem die Studierenden eine eigenständige Arbeit zu einer historischen Debatte im Zusammenhang mit dem Holocaust erstellen.

Der Prüfungsausschuss ist Edexcel. Im Vorfeld der Prüfungen wird ein umfangreiches Wiederholungsprogramm angeboten.

„Ich habe gerade einen erstklassigen Abschluss in Internationaler Geschichte von der University of Leeds erhalten … und ich glaube wirklich, dass dies ohne Ihre kontinuierliche Unterstützung und Ermutigung nicht möglich gewesen wäre.“ Ehemaliger A-Level-Geschichtsstudent.

Folgen Sie der Geschichtsabteilung der Ipswich School auf Twitter @IpswichHistory.

Prüfungsergebnisse

Der Durchschnitt der Ergebnisse in Geschichte während der letzten drei Jahre beträgt:


Geschichte

Ursprünglich in einem eigens errichteten spätviktorianischen Gebäude wurden die Funktionen von Museum, Bibliothek und Kunstgalerie vereint. Die Bibliothek wurde Anfang des 20. Jahrhunderts entfernt, aber die Kunstgalerie und das Museum teilten sich bis in die 1970er Jahre weiterhin Räumlichkeiten.

Museen als Inspiration

Als Museum und Kunsthalle verbunden wurden, lieferten die Sammlungen des Museums direkte Inspiration für die Arbeit sowohl der Studierenden als auch der Mitarbeiter. Einige der frühen Werke von Maggi Hambling und die Vogelskulpturen von Bernard Reynolds stellen eine offensichtliche Verbindung her.

Viele andere Künstler wurden und werden von Museumssammlungen inspiriert, insbesondere von der Idee der "Cabinets of Curiosities", die die Ursprünge moderner Museen bildete und deren Geist auch heute noch einige moderne Museen wie das Pitt Rivers oder die Victorian Gallery durchdringt im Ipswich-Museum. Die frühen Werke von Damien Hirst wurden direkt von diesem Thema inspiriert.

Eine Reihe prominenter Künstler wie Mark Dion verwenden weiterhin die Ideen und Systeme der wissenschaftlichen und musealen Katalogisierung und Klassifikation als Quelle für ihre Werke.

Die Verschmelzung von Museum, insbesondere der Idee der Wunderkammer, und zeitgenössischer Kunst hat eine lange und viel beachtete Tradition und kann in der neuen Kombination weitergeführt werden.

Kunst des 20. Jahrhunderts

Die Benton End Group (manchmal auch The East Anglian School of Painting and Drawing genannt) wurde von Cedric Morris (1889-1982) und Arthur Lett Haines (gest. 1978) zunächst 1937 in Dedham und von 1940 bis Ende der 1970er Jahre in Benton . gegründet Ende, in der Nähe von Hadleigh Suffolk. Es hatte einen großen Einfluss auf viele Suffolk-Maler und leistete vierzig Jahre lang einen wichtigen Beitrag zur Kunstlehre im Osten Englands.

Benton End wurde auf sehr eigenwilligen Linien geführt. Es gab keine formale Lehre, sondern eher die Schaffung einer Umgebung, in der Künstler ihr Potenzial ausschöpfen konnten. Die Atmosphäre inspirierte viele Künstler und war ein prägendes Erlebnis in den frühen Karrieren unter anderem von Lucien Freud und Maggi Hambling. In der Sammlung von Ipswich befinden sich bereits mehrere Gemälde von Künstlern, die mit Benton End verbunden sind, darunter Cedric Morris, Arthur Lett-Haines, Maggi Hambling, Lucy Harwood, Joan Warburton und Glyn Morgan. Andere bemerkenswerte Persönlichkeiten, die von Cedric Morris und der Gruppe beeinflusst wurden, waren auch Beth Chatto.

Die Ipswich School of Art zog auch viele talentierte Künstler, Bildhauer und Grafiker an, darunter Bernard Reynolds, Leonard Squirrel, Lawrence Self und Colin Moss, die in der Sammlung vertreten sind. Einige bemerkenswerte Studenten sind Maggi Hambling und Brian Eno.

Die Nähe der beiden Schulen bedeutete, dass eine Reihe von Künstlern Verbindungen zu beiden hatten oder sich zwischen ihnen befanden, darunter vor allem Maggi Hambling und Bernard Reynolds. Derzeit gibt es auch einige Möglichkeiten, die Werke einiger dieser Künstler, darunter Cedric Morris, sowohl als Beispiele ihrer Kunst, als auch als Illustration ihrer Arbeitsweise erheblich zu erweitern.


Ipswich, Suffolk

Bei seinem Tod im Jahr 1551 hinterließ der wohlhabende Kaufmann Henry Tooley eine große Summe, die verwendet werden sollte, um die Armen von Ipswich zu entlasten und zu beherbergen. Im Jahr 1569 erwarb die in seinem Namen gegründete Stiftung das ehemalige Dominikanerkloster an der heutigen Stiftungsstraße, um das erste Arbeitshaus der Stadt zu errichten, das als Christ-Hospital bekannt wurde. Es konnte 40 Häftlinge aufnehmen, darunter sowohl die „unschuldigen“ Armen (Alte, Waisen, Verwitwete und Kranke) als auch die „faulen“ Armen (Landstreicher, Vagabunden und Bettler). Im Jahr 1574 fand ein größerer Umbau auf dem Gelände statt und es wurden Werkstätten hinzugefügt, um 40 Personen mit Arbeiten wie Kardieren, Spinnen und Weben zu versorgen. Nach der Verabschiedung des Armenfürsorgegesetzes von 1601, das die Verantwortung für die Entlastung der einzelnen Pfarreien auferlegte, scheint das Christ's Hospital aufgehört zu haben, ein städtisches Armenhaus zu sein und stattdessen die Rolle einer Wohltätigkeitsschule zur Erziehung armer Kinder übernommen zu haben.

Ein parlamentarischer Bericht von 1777 listete ein Dutzend in Ipswich in Betrieb befindlicher Pfarreien auf: St. Clement (mit Unterkünften für bis zu 70 Insassen), St. Helen (10), St. Lawrence (25), St. 10), St. Maria am Schlüssel (25), St. Mary Stoke (30), St. Mary Tower (30), St. Matthäus (30), St. Nikolaus (20), St. Peter (28) und St. Stephan (24) .

Nach 1834

Die Ipswich Poor Law Union wurde am 9. September 1835 gegründet. Ihre Tätigkeit wurde von einem gewählten Vorstand von 20 Wächtern beaufsichtigt, der die 14 konstituierenden Gemeinden wie unten aufgeführt vertritt (die Zahlen in Klammern geben die Anzahl der Wächter an, wenn mehr als einer vorhanden ist):

Grafschaft Suffolk: St. Clemens (3), St. Helen, St. Lawrence, St. Margaret (3), St. Mary-at-Elms, St. Mary-at-the-Quay, St. Mary Stoke, St. Mary-at-the-Town, St. Matthew ( 2), St. Nikolaus, St. Peter (2), St. Stephen, Westerfield, Whitton.

Die Bevölkerung, die bei der Volkszählung von 1831 in die Union fiel, betrug 20.528 Einwohner und reichte von Whitton (346 Einwohner) bis St. Clement's (4.779). Die durchschnittlichen jährlichen Niedrigzinsausgaben für den Zeitraum 1833-35 betrugen 13.685 Pfund oder 13,4 Tage. pro Kopf der Bevölkerung.

Great Whip Street Arbeitshaus

Die neue Ipswich Union kaufte ein 3,5 Hektar großes Grundstück in der Great Whip Street vom Christ's Hospital zum Preis von £525 zum Zweck der Errichtung eines Arbeitshauses. Bekannt als St. Peter's Workhouse, wurde es 1836-7 zu einem Preis von £6.585 errichtet und sollte bis zu 400 Insassen aufnehmen. Der Architekt war William Mason, der auch für die Erweiterungspläne für Arbeitshäuser in Hartismere und Bury St Edmunds verantwortlich war.

Das Gebäude der Great Whip Street wurde aus rotem Backstein gebaut. Sein Layout folgte weitgehend dem beliebten kreuzförmigen oder "quadratischen" Design. Sein Eingangsblock in der Great Whip Street enthielt den Sitzungssaal und die Empfangsabteilungen. Nach hinten strahlen vier Unterbringungsflügel von einer zentralen achteckigen Nabe aus. Der äußere Perimeter wurde aus einstöckigen Werkstätten und Nebengebäuden gebildet. Später wurde an der Rückseite des Gebäudes eine Kapelle sowie ein Krankenbau angebaut. Der Standort und das Layout des Arbeitshauses sind auf der folgenden Karte von 1884 dargestellt.

Ipswich Great Whip Street Arbeitshaus Website, 1884.

Heath Road Arbeitshaus und Krankenstation

In den Jahren 1898-9 wurden auf einer grünen Wiese an der Südseite der Woodbridge Road ein neues Pavillon-Plan-Arbeitshaus und eine Krankenstation errichtet. Sein Design wurde für den Wettbewerb geöffnet und die Gewinnerpläne wurden von Stephen Salter und H. Percy Adams mit Lister Newcombe eingereicht. Die Bauarbeiten begannen im Jahr 1896, wobei die Bauherren George Grimwood & Son einen Preis von 25.773 £ für die Arbeiten vereinbart hatten. Die Endkosten des Arbeitshauses, das 369 Insassen aufnehmen konnte, beliefen sich auf über 30.000 Pfund Sterling. Eine Architektenzeichnung zeigt das Gelände aus der Vogelperspektive.

Ipswich neues Arbeitshaus und Krankenstation aus dem Norden, 1899.

Ein Empfangsblock im Nordwesten des Geländes enthielt eine Pförtnerloge, Empfangsstationen und Landstreicherzellen. Im ersten Stock befand sich ein Lagerraum für die Kleidung der Armen.

Ipswich Eingangshütte aus dem Nordosten, 2001.
Kopieren Sie Peter Higginbotham.

Ipswich-Empfangsblock aus dem Nordosten, 2001.
Kopieren Sie Peter Higginbotham.

Das Hauptgebäude des Arbeitshauses bestand aus einem zentralen Verwaltungsgebäude, das durch Korridore mit zweistöckigen Flügeln verbunden war, die für Männer im Westen und für Frauen im Osten standen. Im Erdgeschoss jedes Flügels befanden sich Aufenthaltsräume, Badezimmer, Toiletten, Schlafsäle und Wohnräume für die Kranken. Im ersten Stock befanden sich Schlafsäle. An der Vorderseite des Mittelblocks befanden sich das Komiteezimmer und die Quartiere des Meisters. Auf der Rückseite des Mittelblocks befand sich ein Speisesaal mit 270 Sitzplätzen, der auch als Kapelle diente.

Im Süden des Geländes stand das Arbeitshaus-Krankenhaus.

Ipswich Krankenstation aus dem Südosten, 2001.
Kopieren Sie Peter Higginbotham.

Der Standort und das Layout des Standorts sind auf der Karte von 1903 unten dargestellt.

Im Jahr 1930 wurde die Krankenstation des Arbeitshauses zur Ipswich Borough General Infirmary, wobei die Abteilung des Arbeitshauses als Heathfields Public Assistance Institution weitergeführt wurde. 1955 wurde das Gelände zum Heath Road Wing des Ipswich General Hospital. Das Hauptgebäude des Arbeitshauses wurde abgerissen, aber einige der anderen Blöcke sind erhalten geblieben.

Ipswich ehemaliges Eingangsgelände von Westen, 1950er Jahre.
Kopieren Sie Peter Higginbotham.

Peter Collier, dessen Eltern von 1937 bis 1946 für Heathfields verantwortlich waren, erinnert sich:

Meine Eltern und ich zogen irgendwann 1937 hierher und blieben bis 1946, als wir nach Salford zogen. Mein Vater wurde zum Meister des alten Armenhauses ernannt und während des Krieges auch zum Steward des Lazaretts mit Zuständigkeit für die Laienverwaltung. Das Krankenhaus hatte eine separate Krankenpflegerin.

Der zentrale Block des Arbeitshauses enthielt eine große Wäscherei, die sowohl Arbeitshaus als auch Krankenstation versorgte. Es gab auch eine große Küche, aber ich kann mich nicht erinnern, ob diese beiden Teilen oder nur dem Arbeitshaus diente. Die Anstalt verfügte auch südlich des Krankenhauses über ausgedehntes Land, das eine Farm mit Ackerbau und Viehzucht (mit Sicherheit Rinder und Schweine und möglicherweise einige Arbeitspferde) umfasste. Es gab auch Obstgärten. Das Arbeitshaus hatte einen „Arbeitshof“ unter der Aufsicht eines Arbeitsmeisters, der die Handarbeit der arbeitsfähigen Häftlinge überwachte, z.B. Sägen von Stämmen.

Das Foto unten zeigt die Vorderseite des Arbeitshauses, die mein Vater um 1937 aufgenommen hat. Unsere Unterkunft umfasste das linke Erdgeschoss und das gesamte Erdgeschoss.

Heathfields Eingangsblock von Südosten, um 1937.
& kopieren Peter Collier.

Das Leben im Arbeitshaus war nicht ganz frei von gesellschaftlichen Ereignissen, zumindest was das Personal und die Wächter betraf, wenn man das Bild unten vom "Arbeitshausball" von 1912 nachvollziehen kann. Die Texte, die die Wände schmücken, scheinen jedoch etwas im Widerspruch zu den Abläufen zu stehen.

Ipswich-Arbeitshaus-Ball, 1912.
& kopieren Peter Collier.

St. John's Kinderheim

Ein separates Heim für arme Kinder wurde erstmals um 1870 von der Ipswich Union vorgeschlagen. Dies war zu dieser Zeit ein ungewöhnlicher Schritt für Gewerkschaften außerhalb der Metropolen und war möglicherweise das Ergebnis des Platzmangels im Arbeitshaus Great Whip Street. In den Jahren 1871 und 1873 entstand ein langer Bau mit einem Mittelblock, der von separaten Flügeln mit Jungen- und Mädchenunterkünften flankiert wird. Das Gebäude, das schließlich 1879 in der Bloomfield Street errichtet wurde, beherbergte 80 Jungen und 50 Mädchen. Die Knaben wurden in der Landarbeit, in der Schneiderei, im Schuhmacherhandwerk und im Zimmermannshandwerk unterrichtet. Den Mädchen wurden Handarbeiten und andere Haushaltsfertigkeiten beigebracht, um sie für den Hausdienst auszurüsten. Später kam eine kleine Krankenstation hinzu.

Ipswich St. Johns Kinderheim, 1927.

Ipswich St. Johns Kinderheim, um 1910.
Kopieren Sie Peter Higginbotham.

Ipswich St. Johns Kinderheim, um 1910.
Kopieren Sie Peter Higginbotham.

Ipswich St. John's Children's Home Schreinerei, c.1910.
Kopieren Sie Peter Higginbotham.

Ipswich St. Johns Kinderheim, Anfang des 20. Jahrhunderts.
Kopieren Sie Peter Higginbotham.

Ipswich St. Johns Kinderheim, Anfang des 20. Jahrhunderts.
Kopieren Sie Peter Higginbotham.

Ipswich St. Johns Kinderheim, Anfang des 20. Jahrhunderts.
Kopieren Sie Peter Higginbotham.

Ipswich St. Johns Kinderheim, Anfang des 20. Jahrhunderts.
Kopieren Sie Peter Higginbotham.

Das Grundstück, das später als Freelands bekannt wurde, wurde in den 1970er Jahren abgerissen. Auf dem Gelände befindet sich heute eine Wohnsiedlung.

Mitarbeiter

Häftlinge

Aufzeichnungen

Hinweis: Viele Repositorien sehen eine Schließungsfrist von bis zu 100 Jahren für Aufzeichnungen zur Identifizierung von Personen vor. Überprüfen Sie vor einer längeren Reise immer, ob die Unterlagen, die Sie einsehen möchten, verfügbar sind.

  • Suffolk Record Office, Gatacre Road, Ipswich IP1 2LQ. Zu den Beständen gehören: Protokollbücher der Wächter (1835-1930) Geburten (1836-1938) Todesfälle (1836-1933) Glaubensregister (1906-50) Glaubensregister und Aufzeichnungen des St. John's Children's Home (1882-1950) usw.

Links

Wissen


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Geschichte

Laut Aufzeichnungen, die bis ins Jahr 1689 zurückreichen, war das Anwesen, das heute das Ipswich Inn ist, der Standort mehrerer Häuser. Es war ursprünglich ein Backsteinhaus im Besitz von Herrn Thomas Bracy, der das Anwesen an Robert Paine verkaufte, 'Älter der Kirche von Ipswich'. Wie aus den Aufzeichnungen hervorgeht, war er ein Mann, der sich in erster Linie für den Bildungsfortschritt der Gemeinde einsetzte. Im Jahr 1689 übergab Herr Paine am 12. Februar 1689 den Besitz seines Herrenhauses und drei Morgen Land mit Obstgarten, Garten usw. an seinen Sohn Robert Paine Jr. (IPS. Deeds 5:590).

Ein Jahr später wurde das Grundstück, das aus zwei und drei Viertel Morgen bestand, am 30. September 1690 an Mr. Francis Wainwright verkauft (Ips. Deeds 5:326). Die Wainwrights waren eine berühmte Familie --- Francis, the Einwanderer, der als junger Mann mit großer Auszeichnung im Pequot-Krieg gedient hat. Er wurde ein wohlhabender Kaufmann und prominenter Bürger. Er starb am 19. Mai 1692.

Sein Sohn, ebenfalls Francis genannt, machte 1686 seinen Abschluss am Harvard College. Er war der Oberst eines Regiments, Town Clerk, Repräsentant am General Court, Feoffee und Justice of the General Sessions Court. Er starb am 3. August 1711.

Im achtundvierzigsten Lebensjahr 1740 wurde das Anwesen wieder an Kapitän Thomas Staniford verkauft. Capt Staniford war den Aufzeichnungen zufolge ein "Gentlemen", der das Haus bis zu seinem Tod am 28. Februar 1740 bewohnte. Sein Testament wurde am 7. September 1778 hinterlegt (Pro. Rec. 353: 206), und das Inventar seines Nachlasses, archiviert am 9. Dezember 1778 (353: 316) zeigt die Einrichtung eines der feinen Herrenhäuser der Revolutionszeit, mit den zu dieser Zeit vorherrschenden überhöhten Werten. Interessant sind einige Artikel, die die Garderobe eines damaligen Gentleman und verschiedene Möbelstücke vorgeben.

Der Sohn von Kapitän Thomas Staniford war ebenfalls Kapitän und hieß James. Kapitän James Staniford besetzte das Herrenhaus, das oft als der "alte Ziegelstein" bezeichnet wird, weil es Ziegelenden hatte, und unterhielt ein Gasthaus. Er kaufte auch von Richard Dummer Jewett eine ungeteilte Hälfte von fünf und drei Viertel Morgen des angrenzenden Landes, 28. Mai 1803 (172: 178).

Die Erben von James Staniford und seinem Sohn James verkauften am 10. Juni 1830 "das Ziegelhaus" und achteinhalb Morgen an Dr. Thomas Manning (259:76). Dr. Manning verkaufte "den alten Ziegelstein" an seinen Sohn, Dr. Joseph Manning aus Charleston, SC, 27. Dezember 1830 (266: 73) und er übergab ihn an John Jewett, 9. Dezember 1835 (290: 121). ). Herr Jewett riss das alte Herrenhaus, das sich noch in ausgezeichnetem Zustand befand, ab und baute an seiner Stelle das vor einigen Jahren gekaufte und von Herrn John B. Brown und Herrn Harry B. Brown abgerissene Backsteinhaus.

Das Anwesen ging durch mehrere weitere Familien und wurde schließlich am 27. März 1814 im Besitz von Susanna Wilcomb, die ihr Grundstück an die Treuhänder der Methodist Episcopal Church verkaufte. Auf diesem Grundstück wurde dann ein Versammlungshaus errichtet, das bis zum Bau der heutigen Kirche von der Kirche genutzt wurde. Das Grundstück wurde dann am 17. Mai 1862 von den Treuhändern der Methodist Episcopal Church an Robert Jordan verkauft. Robert Jordan war ein Veteran des Bürgerkriegs, der nach dem Krieg seinen Lebensunterhalt als Kaufmann verdiente. Mr. Jordan baute dieses Haus im April 1863. Jahre später gehörte das Haus Dr. Bailey, einem örtlichen Arzt, der seine Patienten in seiner Praxis im hinteren Teil des Hauses behandelte.

Das Robert-Jordan-Haus ist ein schönes Beispiel eines viktorianischen Stils im italienischen Stil und liegt auf einem Hektar Land im Zentrum des historischen Ipswich. Auf der Rückseite des Anwesens befindet sich ein terrassiertes Land, auf dem Maulbeersträucher für die Seidenraupen- / Seidenindustrie angebaut wurden, die Anfang des 19. Jahrhunderts in Ipswich florierte. Interesting architectural features of the house include the Belvedere on the third-floor roof, the curved front stairway, original ceiling moldings, and the ice house at the rear of the main house, which was part of the &ldquosummer kitchen&rdquo. The carriage house is at the back of the property.

Margaret and I bought this house in 1996. We had been on Pleasant Street for twenty-two years, and after our three kids grew up got married, Margaret decided we needed more room. A bed and breakfast was not in our plans but we began to think of the fun it would be meeting new people, and sharing our home with strangers that wanted to pay us for being here (a no-brainer). So, out of those thoughts and dreams, came our B&B, which grew to become The Ipswich Inn.

This is our 20th year. All we wanted and wished for has come true. This has been a great adventure that continues to bring more and more people into our lives that have become friends. We truly hope your stay with us and your meal will be as pleasant and restful as the joy we have in bringing it to you.


The Regent Theatre Ipswich opened in 1929 as a cine-variety hall. At 7.00pm on Monday November 4th, the entrance doors of the new Regent, Ipswich opened and into its spacious foyer crowded nearly 2,000 Ipswich people who had come to witness this momentous occasion.

Ipswich Regent Theatre Opening Night 1929

Opening night screening of The Last of Mrs. Cheyney

1963 Show Poster for The Beatles Headlining at the Ipswich Regent Theatre then known as The Gaumont

The Beatles Headlining at the Ipswich Regent Theatre in 1963 then known as The Gaumont

Outside the theatre a large queue had formed, filing past Botwoods Garage. As a Ransomes steam lorry tooted its whistle, the staff of the Regent lined up for their first inspection by the manager, Albert E. Crabb who checked their ‘electric’ torches.

On the stage, the Mayor of Ipswich, Dr Hossack, performed the opening ceremony musical numbers were played on the brand new Wurlitzer organ by the resident organist Frank Newman F.R.C.O. that included the Merry Wives of Windsor by Otto Nicolai. The film chosen to open the venue then began – “The Last of Mrs Cheyney” starring Norma Shearer and Basil Rathbone – an ‘all-talking’ picture with front circle seats costing 2s / 4d.

The luxurious Regent restaurant enhanced a visit to the theatre and, if desired, tea could be served in any of the fourteen boxes at the rear of the stalls. The boxes and the Manager’s cottage at the rear of the theatre are unique features of the Regent.

Before World War II, the stage was not used to any great extent, although up to the mid-1930’s, the 18 piece Regent Orchestra, under the direction of Louis Baxter frequently entertained the audiences. Most theatre orchestras were disbanded in the late 1930’s and the organ then became the principal musical attraction.

During the war the Regent provided much needed escapism and helped sustain public morale. After the war, The Regent flourished and enjoyed an attendance boom. Also during this period, the stage was employed in the presentation of Ipswich Civic Concerts. The stage was also used for the presentation of Sadler’s Wells Ballet, Carl Rosa Opera and one-night band shows.

The popularity of cinema in the 1930’s and 40’s was so great that another cinema in Ipswich, The Ritz, was opened in 1937. But the advent of television in the 1950’s proved a testing time for cinemas up and down the country and even the highly successful Regent, by now known as the Gaumont, did not survive intact. To allow the cinema to become more profitable, the restaurant was closed down and replaced by the Victor Sylvester Dance Studio.

In the late 1950’s the ‘pop’ music phenomenon exploded. Buddy Holly and the Crickets started off the craze at the Gaumont and since then thousands of international artists have graced the theatre’s stage including the Beatles, Tina Turner, The Bay City Rollers, Tom Jones, Chris Rea, Status Quo and many of today’s top artistes.

From 1958, local musicians and dramatic societies were encouraged to perform at East Anglia’s largest theatre. These included the Ipswich Operatic Society, the Gilbert and Sullivan Society and later the Co-op Juniors. The programme has since included a wide range of productions including professional touring theatre, opera, ballet, comedy and full-scale orchestras.

By 1965 the proprietors, The Rank Organisation, were sufficiently confident of the future to spend £50,000 on a major modernisation and redecoration programme. But by the 1970’s, the large cinemas that had been so successful in the 30’s and 40’s proved to be less economically viable.

The Gaumont’s dance studio was converted to a luxury 200-seat cinema, which could be rented out for use by the local business community. Rank also proposed to convert the main auditorium to a multi-screen complex. However, after a great deal of persuasion, Rank’s plans were abandoned because the auditorium was established as the only local venue of sufficient capacity to stage live shows and concerts despite its limited performance facilities.

The theatre was re-launched in September 1991 after Ipswich Borough Council successfully negotiated the ownership from the Rank Organisation and NCP. Today, Ipswich Borough Council continues to fund the theatre as part of its arts and entertainment portfolio which also includes the Corn Exchange and Ipswich Film Theatre.

Based on an article written by David Lowe, Manager 1958-1989.


Materials and methods

Nanopore sequencing and datasets

Nanopore sequencing data for NA19240 [26], NA12878 [24], and Ashkenazi trio [29] human cell lines are publicly available. A complete description of the datasets, their base calling, mapping, and usage in our study are provided in additional file 1 along with the link to the sources.

We also sequenced the Colo829BL B-lymphoblast cell line using one nanopore PromethION flow cell and Illumina paired-end sequencing at 30× coverage. A complete description of nanopore and Illumina sequencing protocols and data obtained is also provided in Additional file 1.

CpG methylation calling from nanopore data

To call CpG methylation, we benchmarked three model-based approaches: Nanopolish [10], Megalodon [14], and DeepSignal [15]. Nanopolish uses a hidden Markov model to call CpG methylations from raw nanopore data while Megalodon and DeepSignal use neural networks. We called CpG methylation using these tools (with the default parameters) for 12 flow cells of NA12878 publicly available data (Additional file 1) and compared the results with WGBS data from ENCODE project (ENCFF835NTC) [51] and Human Methylation 27 (27k) array from Fraser et al. [25].

Variant calling

We used Clair to call SNVs [22]. We called variants for each chromosome using clair.py callVarBam --threshold 0.2 und der HG122HD34 model. Indels were filtered out. To evaluate variant calling, we compared SNVs called by Clair from nanopore data to those from 1KGP phase 3 [30] (GRCh37 coordinates). Clair’s variant calls were lifted over to GRCh37 human reference genome coordinates using CrossMap [52] for comparison to 1KGP data.

For our in-house Colo829BL sample, we compared Clair variant calls to Strelka [53] v 2.9.10 calls made from paired-end Illumina reads (Additional file 1).

Model training to improve SNV calling

We calculated average qualities and mutation frequencies for each position of each 5-mer window containing an SNV. Mutation frequencies were calculated as the number of instances over coverage for each genomic position in the 5-mer window. Base qualities for a given position were calculated as the average of all base qualities mapped to the position. We used these as inputs to a fully connected artificial neural network classifier composed of four hidden layers with a relu activation function. The first hidden layer is six times larger than the input layer and the size of subsequent hidden layers decreases through a factor two.

We trained three models to compare the classifier using different coverages. NA12878 20 flow cells (24×), NA12878 all flow cells (44×), and HG003 (80×) were used for training. First, we called variants for each dataset using Clair and then determined true and false positives using high-quality variants using the Genome in a Bottle database (GIAB) [27]. Using NA12878 20 flow cell data, a randomly selected balanced dataset of 25 million 5-mers was used for training and 4 million unseen randomly selected 5-mers were used as the validation set. For the NA12878 whole dataset and HG003 sample, the training datasets were 18M and 14.9M, respectively, and validation sets were 2.5M and 2M, respectively (Additional file 2: Fig. S6). The NA12878 20 flow cell model was used for < 30× coverage data, NA12878 all flow cells for 30×–45× coverage data, and HG003 model for > 45 coverage data.

Phasing single nucleotide variants detected from nanopore sequencing

In order to phase nanopore reads and CpG methylation, we first called SNVs for both samples (NA19240 run 1 and Colo829BL) using Clair [22], then used SNVoter to normalize the quality scores and filter out false positives (Fig. 2e and Table 1). Finally, we used WhatsHap [23, 31] v0.18 with the default parameters and --ignore-read-groups on to determine haplotype status for each SNV.

Phasing of nanopore reads and CpG methylations

Phased SNVs and CpG methylation calls were leveraged to phase reads along their CpG methylation to diploid haplotypes. After filtering out a considerable number of false-positive SNVs using SNVoter, we still noticed 10–20% false-positive SNV calls in the datasets (Table 1). These unfiltered false-positive calls, in addition to sequencing errors, can result in reads incorrectly mapping to the SNVs from haplotype 1 when the read would actually belong to the haplotype 2 and vice versa. We noticed reads presenting SNVs from both haplotypes when mapping them to phased SNVs. In NA19240 run 0, out of

3M reads which mapped to at least one phased SNV,

2M reads had SNVs from both haplotypes (Additional file 2: Fig. S7a). To further overcome false positives and the sequencing error problem, we made several filtering steps to account for remnant false-positive SNVs and haplotype ratio (number of SNVs from HP1/HP2 or HP2/HP1). As we analyzed NA19240 run 0, we noticed a lower base quality distribution for false-positive SNVs compared to true positives that could not be filtered out by SNVoter (Additional file 2: Fig. S7b). Therefore, we assigned a minimum base quality threshold to successfully map each read at a phased SNV position. To manage reads containing SNVs from both haplotypes, we defined another threshold, the haplotype ratio, which ensures the reads are assigned to a single haplotype. Based on the quality distribution of SNVs (Additional file 2: Fig. S7b), the proportion of false positives which is between 10 and 20% (Table 1) and haplotype ratios (Additional file 2: Fig. S7a), and also based on empirical phasing at a few known imprinted regions, we used seven as the minimum base quality and 0.75 as haplotype ratio. We also used two as the minimum number of phased SNVs a read must present to be considered for phasing. In order to assign a read to a defined haplotype, a read must satisfy the following criteria:

As the reads are separated to different haplotypes, their associated CpG methylations from processed methylation call file are also separated to the corresponding haplotypes. We have integrated all the steps and filters in our python3 command-line tool, NanoMethPhase. Users can input methylation call data from Nanopolish, phased variant calling file, alignment file, and reference genome to NanoMethPhase (Fig. 3c). NanoMethPhase will output phased reads in aligned format, phased mock WGBS converted format for visualization (see the “Visualization” section Fig. 4c, d), phased methylation calls, and methylation frequency files. The latter can be used for differential methylation analysis to detect DMRs between haplotypes.

Differential methylation analysis

After phasing reads and CpG methylation to haplotypes, NanoMethPhase can perform DMA to detect mono-allelic methylated regions. It uses the DSS R package [36] for DMA. Users can perform all analyses in a command-line interface and directly perform DMA using the dma module of NanoMethPhase on the output phased methylation frequency data to detect DMRs.

Visualisierung

NanoMethPhase can convert phased reads into separate mock-WGBS bam files using the processed methylation call file from its methyl_call_processor module. Each cytosine in each CpG in each read is converted to a T, A, or N depending on the CpG being called as methylated, unmethylated, or uncalled. These pairs of files can be loaded into a genome browser such as IGV [34] in bisulfite mode for visualization (Fig. 4c, d).


Methoden

Strains and growth conditions

Escherichia coli DH5α was used for plasmid amplification. T. reesei Rut-C30 (ATCC 56765), NG14 (ATCC 56767), and PC-3-7 (ATCC 66589) were purchased from ATCC (American type culture collection). T. reesei strain QM6a (ATCC 13631), QM9414 (ATCC 26921), and RL-P37 (NRRL 15709) were respectively purchased from DSMZ (Deutsche Sammlung von Mikroorganismen und Zellkulturen), Institute of Microbiology-Chinese Academy of Sciences, and NRRL (Agriculture Research Service Culture Collection). E. coli was cultured in Luria broth (LB) medium. All the strains of T. reesei were cultivated at 28 °C (200 rpm) in 2× Mandels’ medium (1.0 g/L yeast extract, 3 g/L peptone, 0.6 g/L urea, 2.8 g/L (NH4)2SO4, 4.0 g/L KH2Bestellung4, 0.5 g/L CaCl2, 0.6 g/L MgSO4∙7H2O, 5 mg/L FeSO4∙7H2O, 1.6 mg/L MnSO4∙4H2O, 1.4 mg/L ZnSO4∙7H2O, and 20 mg/L CoCl2∙6H2O) in which 2% glucose, 2% lactose, or 1% (w/v) Avicel was used as carbon source [31]. In addition, all these strains were maintained on potato dextrose agar (PDA) plates at 28 °C for the generation of conidia.

Plasmid construction, Agrobacterium-mediated transformation, and transformants screening

The primers used in this study are listed in Additional file 8: Table S2. LML2.1 [32] was used as a skeleton for the two plasmids, plasmidA734 and plasmidA723, to obtain two types of transformants bearing the ACE3-734 and ACE3-723 protein, respectively. The 5′- and 3′-arms of the homology double exchange for ACE3-734 and ACE3-723 sequences were constructed as described by Zhang et al. [26]. The DNA fragment of the 5′-arm of truncated ACE3-723 (approximately 900 bp) was cloned using the genome of Rut-C30 and the primer pair ace3-1/ace3-2723. Similarly, the fragment of the 5′-arm of native ACE3-734 (approximately 1000 bp) was cloned using the QM6a genome and the primer pair ace3-1/ace3-2734. The 3′-arms of these structures (about 1000 bp) were amplified from Rut-C30 or QM6a genomic DNA using the primer pair ace3-3/ace3-4. KOD-Plus-Neo (TOYOBO, Japan) was used for PCR. Next, the 5′- and 3′-arms of ACE3-723 and ACE3-734 were ligated in an orderly manner into PacI/XbaI and SwaI sites of linearized LML2.1 [32] to form PlasmidA723 and PlasmidA734, bzw. The transformation experiments were performed using Agrobacterium-mediated transformation as described by Zhang et al. [32]. Correct intermediate transformants of A723 and A734, obtained by a homologous double exchange, were checked by diagnostic PCR [33] and quantitative PCR (qPCR Additional file 2) [34,35,36] to avoid unspecific locus integration (ectopic integration events). The primer pairs ace3-CF/D70-4 and HG3.6/ace3-CR were used in diagnostic PCR (Additional file 3: Figure S2A-B), which was followed by DNA sequencing (Additional file 3: Figure S2E) to confirm the correct knock-in at the ace3 locus in T. reesei genomes. The single-copy DNA fragment integration in transformed clones was verified by qPCR (Additional file 3: Figure S2C-D). The hygromycin marker gene in the transformants was excised using xylose-induced cre recombinase expression [32], and then the intermediate transformants were turned into the final transformants by excising the hygromycin marker gene. The final transformants were obtained and confirmed by hygromycin sensitive phenotype and with the second-round diagnostic PCR. Thus, the final A723/A734 transformants were used for further analysis.

Cellulase production in a shake flask and fermenter culture

Cellulase production in a shake flask was conducted according to a previously described method [26], with some modification. In brief, conidia (final concentration 10 6 /mL) of T. reesei strains were grown at 28 °C, in 20 mL of 2× Mandels’ medium containing 2% (w/v) lactose or 1% (w/v) Avicel (PH-101, Sigma-Aldrich) as the sole carbon source. The biomass dry weights were indirectly measured by calculating the total amount of intracellular proteins [37]. The supernatant was used for cellulase assays. Mycelia were collected for RNA extraction.

The activity of the produced cellulase was measured as described in another study [38]. In brief, the PNPCase and PNPGase activities were determined against 5 mM P-nitrophenol- d -cellobioside (PNPC, Sigma-Aldrich) and P-nitrophenyl β- d -glucopyranoside (PNPG, Sigma-Aldrich) as substrates in 50 mM sodium acetate buffer at pH 5.0 at 50 °C for 30 min, respectively. The release of P-nitrophenol was determined by measuring absorbance at 405 nm. One unit of PNPCase and PNPGase activities was defined as 1 μmol of P-nitrophenol released per minute. The CMCase activities were determined by incubation in 50 mM sodium acetate buffer with 1% carboxymethylcellulose (CMC, Sigma-Aldrich), at pH 5.0, 50 °C and for 30 min. The FPase activities were determined using Whatman filter paper as the substrate with a 50 mM sodium acetate buffer at pH 5.0, 50 °C, and for 30 min. One unit of CMCase or FPase activity was defined as the amount of enzyme producing 1 μmol of reducing sugar per min.

Cellulase production in a fermenter culture was conducted according to the method described by Li et al. [39] with some modification. In brief, fermentation was carried out in the 30-L fermenter (Shanghai Bailun Bio-technology Co., Ltd.) with an initial working volume of 10 L at 28 °C for mycelial growth. Seed cultivation was performed as follows: for each strain, about 10 9 conidia were inoculated into 1 L of 2× Mandels’ medium and 20 g/L of glucose, then cultivated by rotation (200 rpm) at 28 °C for 2 days. This culture was poured into 9 L of fresh 2× Mandels’ medium containing 10 g/L of wheat bran and 15 g/L of Avicel in a 30 L jar fermenter. A mixture of glucose and β-disaccharides (MGDS SUNSON ® , Beijing, China) was fed after inoculation. The feeding took place every 6 h, which maintained glucose concentration low, between 0.05 g/L and 0.30 g/L. The temperature was decreased to 25 °C after 48 h for more efficient cellulase production. The dissolved oxygen (DO) and pH were controlled as described by Li et al. [39]. The samples were taken every 24 h, and the supernatant was analyzed for the FPase, PNPCase, PNPGase, and CMCase activities. Mycelia were collected for biomass measurement.

RNA extraction and real-time reverse-transcription polymerase chain reaction (RT-qPCR)

The methods used for RNA extraction and RT-qPCR methods are as those described by Chen et al. [33]. In brief, total RNA was extracted from cell fresh weight using a FastRNA Pro Red Kit (MPbio, Irvine, CA, USA). Synthesis of cDNA from total RNA was performed using the TransScript One-Step gDNA Removal and cDNA Synthesis SuperMix (TransGen, Shanghai, China), according to the manufacturer’s instructions. For RT-qPCR, the PerfectStart™ Green qPCR SuperMix (TransGen, Shanghai, China) was used (see Additional file 8: Table S1). The transcriptional levels of the sar1 gene and the RNA of the parental strain were measured for reference calculation and data normalization. Primers used in RT-qPCR are listed in Additional file 8: Table S2.

Pre-treatment and enzymatic hydrolysis of lignocellulose biomass

Dry dilute acid pretreated and bio-detoxified corn stover (containing 37.6% cellulose and 4.4% hemicellulose) was donated by Professor Jie Bao [40]. The hydrolysis efficiency of the crude cellulase was evaluated by mixing 5% (w/v) dry pretreated and bio-detoxified corn stover as a substrate and the same amount of crude enzyme (5 mL) in 50 mM phosphate buffer to a final volume of 20 mL at 50 °C and pH 5.0 for 72 h. The glucose concentration in the supernatant was determined using a glucose assay kit and glucose yield was analyzed as described by Li et al. [39]. In brief, the glucose concentration in the supernatant was measured with the GOD (glucose oxidase) method. The glucose yield was calculated as follows: Glucose yield (%) = (Glucose (g) × 0.9 × 100)/(Cellulose in substrate (g)).

Statistical analysis

All experiments were performed with at least three independent samples with identical or similar results. The error bars indicate standard deviation (SD) of the mean of triplicates. Student’s T test was used to compare two samples, and Duncan’s multiple-range test was used for multiple comparisons. Within each set of experiments, P < 0.05 was considered significant.


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